Mutasi Dibalik Keparahan Varian Delta

AsianScientist (29 November 2021) – Dari Alfa hingga Beta dan sekarang Omicron, kita semua mungkin sedikit lebih akrab dengan alfabet Yunani daripada sebelumnya, berkat varian SARS-CoV-2 yang muncul dalam beberapa bulan sejak pandemi COVID-19 merebut dunia.

Dari semua varian yang diidentifikasi, varian B.1.617.2 atau Delta, menjadi yang paling memprihatinkan. Orang yang terinfeksi varian Delta menderita gejala yang lebih parah dan lebih mungkin memerlukan rawat inap daripada mereka yang terinfeksi varian virus lainnya. Yang mengkhawatirkan, varian Delta juga tampak lebih menular daripada varian sebelumnya, sehingga menyebabkan lonjakan kasus COVID-19 di banyak negara.

Namun, tidak jelas apa yang membuat varian Delta berperilaku seperti ini.

Sekarang, para peneliti dari Jepang mungkin telah mengidentifikasi alasan keparahan varian Delta: mutasi pada protein lonjakan yang meningkatkan kemampuan virus untuk menyatu dengan sel inang dan menghasilkan gejala yang lebih parah daripada virus SARS-CoV-2 asli.

Dipimpin oleh Associate Professor Universitas Tokyo Sato Kei, para peneliti menganalisis genom varian SARS-CoV-2 dari garis keturunan B.1.617, di mana varian Delta adalah bagiannya, dan mengidentifikasi mutasi yang sangat dipertahankan dalam garis keturunan.

Mutasi, bernama P681R, unik untuk garis keturunan dan terletak dekat dengan situs pembelahan furin protein spike, area yang penting untuk fusi dengan dan masuk ke dalam sel inang.

Untuk menguji bagaimana mutasi mempengaruhi virus, para peneliti menghasilkan virus buatan yang membawa mutasi P681R yang sama dan melakukan eksperimen virologi untuk menguji kemampuan pertumbuhan dan fusinya. Temuan menegaskan itu menunjukkan peningkatan kemampuan fusi sel yang sama seperti virus varian Delta dalam pengaturan laboratorium.

“Data ini menunjukkan bahwa mutasi P681R meningkatkan dan mempercepat fusi yang dimediasi SARS-CoV-2 S,” tulis para peneliti.

Peningkatan kemampuan fusi dikaitkan dengan penyakit yang lebih parah pada beberapa virus lain seperti ensefalitis HIV-1 dan campak.

Demikian juga dalam penelitian ini, Sato dan rekan-rekannya menemukan bahwa hamster yang terinfeksi virus pembawa P681R menunjukkan pola perkembangan penyakit yang sama dengan mereka yang terinfeksi varian Delta: kedua kelompok kehilangan lebih banyak berat badan dan menderita gejala paru yang lebih buruk daripada hamster yang terinfeksi strain lain dan virus tanpa mutasi.

Menurut para peneliti, peningkatan kemampuan fusi yang diberikan oleh mutasi dapat berperan dalam efek varian Delta yang lebih parah pada tubuh.

“Data kami menunjukkan bahwa mutasi P681R adalah ciri fenotipe virologi dari varian B.1.617.2/Delta,” tulis mereka. “Temuan ini menunjukkan bahwa peningkatan fusogenisitas virus, yang dipicu oleh mutasi P681R, terkait erat dengan patogenisitas virus.”

Para peneliti selanjutnya berhipotesis bahwa pendekatan serupa untuk mengidentifikasi dan menguji mutasi unik pada varian Delta dapat membantu menjelaskan mengapa hal itu sangat menular.

Artikel tersebut dapat ditemukan di: Saito et al. (2021) Peningkatan fusogenisitas dan patogenisitas mutasi Delta P681R SARS-CoV-2.

———

Sumber: Universitas Tokyo; Foto: Shutterstock.
Penafian: Artikel ini tidak mencerminkan pandangan AsianScientist atau stafnya.